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Ambientato quattro anni dopo la conclusione degli eventi di StrikerS, Nanoha Vivid ha come protagonista Vivio, la figlia adottiva di Nanoha e Fate che ora conduce una vita tranquilla assieme alle sue mamme.
Come hobby principale Vivio pratica le “Strike Arts”, una forma di arte marziale denominata che impiega anche la magia, assieme alle amiche Rio e Corona sotto la guida di Nove, ex appartenente alla truppa dei cyborg e ora entrata nella famiglia Nakajima.
Un giorno però iniziano ad arrivare notizie di un misterioso combattente che assale per ignoti motivi vari esperti delle Strike Arts…